結論
ソフトウェアアップデートを行ったら直りました。バグ？状況
- Magic Mouse 2を使用
- 充電は100%
- 3分に1回ぐらい途切れる
- 電池を入れ直すか、ボタンを何度も押すと再接続される
その他の修正方法
検索するといろいろと出ては来ます。一旦Bluetoothから削除するとか、Bluetoothの設定をリセットするとか、Macを再起動するとか、電池の端子を掃除するとか（僕のマウスは充電式なので端子は無いのですけど）、その他難しそうな情報も。全部は試していないのでなんとも言えませんが、少なくとも手軽にやれるもの（再起動やBluetoothへの再登録など）は効果がありませんでした。結果的に僕の場合はOSのアップデートで直ったので、1つ前のアップデートにバグがあったのかも知れません。もしそういうわけでもない、という方がいれば、この辺参考にしてみてください。
マジックマウスがすぐ切れる！Bluetooth接続が不安定な時に試したい１０の方法 | iMac
Macでマウス（Magic Mouse）のBluetooth接続が切れる時に試すべき３つの方法 – saketorock
